Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc5Q9QX29 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms