Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mid2Q9QUS6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mid2Q9QUS6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms