Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cln8Q9QUK3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cln8Q9QUK3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms