Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdkl2Q9QUK0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl2Q9QUK0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms