Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk1eQ9JMK2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms