Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Crlf1Q9JM58 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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