Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf19Q9JLL3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tnfrsf19Q9JLL3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tnfrsf19Q9JLL3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf19Q9JLL3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms