Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkd2l2Q9JLG4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pkd2l2Q9JLG4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms