Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsmQ9JL96 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsmQ9JL96 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms