Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Upk3aQ9JKX8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms