Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX3

Tfr2, Transferrin receptor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfr2Q9JKX3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tfr2Q9JKX3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfr2Q9JKX3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms