Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ldb3Q9JKS4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms