Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
AtrQ9JKK8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms