Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl39Q9JKF7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl39Q9JKF7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms