Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ybx3Q9JKB3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms