Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msgn1Q9JK54 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msgn1Q9JK54 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms