Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT0

Rcl1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcl1Q9JJT0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcl1Q9JJT0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcl1Q9JJT0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcl1Q9JJT0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms