Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Herpud1Q9JJK5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms