Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip1Q9JJ57 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnip1Q9JJ57 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnip1Q9JJ57 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnip1Q9JJ57 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip1Q9JJ57 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip1Q9JJ57 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip1Q9JJ57 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip1Q9JJ57 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip1Q9JJ57 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms