Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smad9Q9JIW5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad9Q9JIW5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad9Q9JIW5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms