Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc4Q9ES56 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms