Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Slc28a3Q9ERH8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slc28a3Q9ERH8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc28a3Q9ERH8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms