Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snap29Q9ERB0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snap29Q9ERB0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms