Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dap3Q9ER88 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms