Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scn4aQ9ER60 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scn4aQ9ER60 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scn4aQ9ER60 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Scn4aQ9ER60 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scn4aQ9ER60 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scn4aQ9ER60 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scn4aQ9ER60 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scn4aQ9ER60 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scn4aQ9ER60 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scn4aQ9ER60 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn4aQ9ER60 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn4aQ9ER60 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn4aQ9ER60 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn4aQ9ER60 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms