Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Capn12Q9ER56 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Capn12Q9ER56 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms