Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms