Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfgap1Q9EPJ9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfgap1Q9EPJ9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms