Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD06

Rarres2, Retinoic acid receptor responder protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres2Q9DD06 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rarres2Q9DD06 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rarres2Q9DD06 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms