Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Aph1cQ9DCZ9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms