Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnft1Q9DCN7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms