Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf1Q9DBU0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm9sf1Q9DBU0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms