Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc97Q9DBT3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms