Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Swt1Q9DBQ9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Swt1Q9DBQ9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms