Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim23Q9DAL0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim23Q9DAL0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms