Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms