Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms