Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9D9H8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9D9H8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9D9H8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9D9H8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D9H8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D9H8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D9H8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D9H8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9D9H8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9D9H8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9H8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9D9H8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms