Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldnd2Q9D9H2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms