Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms