Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chp2Q9D869 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Chp2Q9D869 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms