Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn22Q9D7U6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms