Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chmp5Q9D7S9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp5Q9D7S9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms