Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem54Q9D7S1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms