Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp4cQ9D7F7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms