Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Borcs6Q9D6W8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Borcs6Q9D6W8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Borcs6Q9D6W8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms