Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc9bQ9D6E4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttc9bQ9D6E4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms