Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms