Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms