Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc7Q9D541 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc7Q9D541 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms